
Setelah penjahat super Shredder lolos dari tahanan, ia bergabung dengan ilmuwan gila Baxter Stockman dan dua antek bodoh, Bebop dan Rocksteady, untuk melancarkan rencana jahat untuk menguasai dunia. Saat Turtles bersiap menghadapi Shredder dan kru barunya, mereka mendapati diri mereka menghadapi kejahatan yang lebih besar dengan niat yang sama Krang yang terkenal kejam.